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Séminaires, publications et évènements

présentation
Séminaire d'unité
12h30

A vos agendas ! Dates des séminaires SPHERE 2023-2024

RDV chaque mois à 12h30 :

  • Vendredi 22 septembre 2023 : Myriam Blanchin et Jean-Benoit Hardouin
  • Lundi 9 octobre 2023 : Alexandra Jobert
  • Lundi 13 novembre 2023 : Sophie Leducq
  • Vendredi 8 décembre 2023 : Morgane Houix
  • Jeudi 18 janvier 2024 : Valentin Maisons
  • Mardi 13 février 2024 : Marine Naudin
  • Lundi 18 mars 2024 : Rajae Touzani
  • Jeudi 18 avril 2024 : Laura Foucault-Fruchard
  • Mardi 21 mai 2024 : François Chaumier
  • Mardi 18 juin 2024 : Sonia Prot-Labarthe
Lieu : IRS2 à Nantes, salle Orange à Tours ou visio (lien zoom à demander si besoin)

Responsables des séminaires : mailto:solene.desmee@univ-tours.fr et mailto:jean-francois.huon@univ-nantes.fr

SMMR
Publication
08/2023

Restricted mean survival time to estimate an intervention effect in a cluster randomized trial

Auteur(s) de la publication : Floriane Le Vilain–Abraham, Elsa Tavernier, Etienne Dantan, Solène Desmée and Agnès Caille

Pour des données de temps d'évènement, la différence de temps de survie moyen restreint (RMST) est une mesure de l’effet de l’intervention, alternative au rapport des risques instantanés, correspondant au gain d'espérance de vie obtenu grâce à l’intervention jusqu’à un temps prédéfini t*. Nous avons étendu deux approches existantes d’estimation du RMST pour des données indépendantes à des données corrélées dans le cadre d’essais randomisés en clusters : l’une basée sur l’intégration directe des courbes de Kaplan-Meier et l’autre basée sur la régression de pseudo-valeurs. Ensuite, nous avons mené une étude de simulation pour évaluer et comparer les performances statistique des méthodes proposées, en faisant varier le nombre et la taille des clusters, le degré de corrélation et l’ampleur de l’effet d’intervention sous l’hypothèse de risques instantanés proportionnels et non proportionnels.

SMMR
Publication
12/07/2022

Enhancing Emotional Skills of Managers to Support the Return to Work of Cancer Survivors: A Research Opinion Focusing on Value, Feasibility and Challenges

Auteur(s) de la publication : Marie Viseux, Sietske J. Tamminga, Michiel A. Greidanus, Bertrand Porro, Yves Roquelaure, Marianne Bourdon
Front. Psychol.
Publication
24/09/2022

Posttraumatic growth inventory: challenges with its validation among French cancer patients

Auteur(s) de la publication : Yseulys Dubuy, Véronique Sébille, Marianne Bourdon, Jean-Benoit Hardouin, Myriam Blanchin
BMC Medical Research Methodology
Publication
10/2022

Heterogeneity in pragmatic randomised trials: sources and management

Auteur(s) de la publication : Bruno Giraudeau, Agnès Caille, Sandra M. Eldridge, Charles Weijer, Merrick Zwarenstein and Monica Taljaard6
BMC Medicine
ifac
Publication
01/08/20

Impact des bonus sur les comportements de jeu des joueurs en ligne: étude longitudinale basée sur les données de comptes joueurs

Auteur(s) de la publication : Marianne Balem, Bastien Perrot, Jean-Benoit Hardouin, Elsa Thiabaud, Anaïs Saillard, Marie Grall-Bronnec, Gaëlle Challet-Bouju

Objectifs: estimer si l'utilisation de bonus a un impact significatif sur les comportements de jeu des joueurs en ligne et décrire cette relation temporelle dans un environnement de jeu réel. Design: cette étude observationnelle longitudinale fait partie de la deuxième étape du programme de recherche EDEIN (Etude de Dépistage des comportements Excessifs de jeu sur INternet). Origine des données: Autorité de Régulation des Jeux En Ligne - ARJEL (actuellement nommée Autorité Nationale des Jeux - ANJ) (poker, paris hippiques et paris sportifs) et opérateur de loterie nationale française (loteries et jeux à gratter). Participants: 9306 joueurs ayant joué au poker, aux courses de chevaux ou aux paris sportifs, et 5682 joueurs ayant joué aux loteries et aux jeux de grattage ont répondu à une enquête en ligne. Le ratio hommes-femmes était largement en faveur des hommes (environ 90 % pour le poker, les paris hippiques et les paris sportifs, et 65 % pour les loteries). L'âge médian variait de 35 ans (paris sportifs) à 53 ans (paris hippiques et loteries). Mesures: l'enquête en ligne comprenait l'Indice Canadien du Jeu Excessif (ICJE) pour déterminer le statut des joueurs (à risque ou non). Les données de comptes joueurs étaient agrégées de façon hebdomadaire et comprenaient l'intensité du jeu (mises, dépôts), la fréquence de jeu (nombre de jours de jeu), deux indicateurs de comportements de jeu à risque (chasing et implication) et l'utilisation de bonus. Résultats: l'utilisation de bonus était associée à une augmentation de l'intensité du jeu (β entre -0,06 [-0,08 ;-0,05] et 0,57 [0,54 ; 0,60]), de la fréquence du jeu (β entre 0,12 [0,10 ; 0,18] et 0,29 [0,28 ; 0,31]), et des comportements de jeu à risque (OR entre 1,32 [1,16 ; 1,50] et 4,82 [4,61 ; 5,05]), à la même semaine que leur utilisation. Cet effet était plus marqué pour les comportements de jeu à risque et les joueurs à risque. Conclusion: les bonus pourraient représenter un facteur de risque de développer ou d'exacerber des problèmes de jeu.

gambling tracking data, online gambling
Addiction
Publication
04/07/20

Association de mesures de corrélation intra-cluster avec la prévalence de l'outcome pour des outcomes binaires dans des essais randomisés en cluster

Auteur(s) de la publication : Mbekwe Yepnang, A. M., Caille, A., Eldridge, S. M., & Giraudeau, B
Statistical Methods in Medical Research
donut_Caille_2021
Publication

Revue méthodologique : Les critères de jugement de type survie sont souvent gérés de façon inadéquate dans les essais randomisés en cluster

Auteur(s) de la publication : Agnès Caille, Elsa Tavernier, Monica Taljaard, Solène Desmée

Objectifs : Estimer la prévalence des critères de type survie (TTE) dans les essais randomisés en cluster (CRTs) et examiner leur traitement statistique.
Méthode : Nous avons identifié sur PubMed les rapports de CRTs publiés dans six journaux médicaux généraux (2013-2018). La nature des critères de jugement et, pour les critères TTE, les méthodes statistiques de calcul du nombre de sujets nécessaires, d'analyse et de mesures de la corrélation intra-cluster ont été extraits.
Résultats : Une analyse TTE était utilisée dans 17% des CRTs (32/184) ou bien lors d'une analyse primaire ou secondaire, ou bien dans une analyse de sensibilité. Parmi les cinq CRTs avec un critère de jugement principal TTE, deux prenaient en compte à la fois la corrélation intra-cluster et la nature TTE des données dans le calcul du nombre de sujets nécessaires ; un rapportait une mesure de la corrélation intra-cluster dans l'analyse. Parmi les 32 CRTs avec au moins une analyse TTE, 44% (14/32) prenaient en compte le clustering dans toutes les analyses TTE. Nous avons identifié 12 CRTs supplémentaires dans lesquels il y avait au moins un critère non analysé comme TTE mais pour lequel une analyse TTE aurait pu être préférable.
Conclusion : Les critères de jugement de type survie ne sont pas rares dans les essais randomisés en cluster mais des méthodes statistiques appropriées sont rarement utilisées. Nos résultats suggèrent que des développements méthodologiques et des recommandations claires pour les critères TTE dans les CRTs sont nécessaires.

Journal of Clinical Epidemiology
séminaire 27 mai 2021
Séminaire d'unité
27/05/2021 12h30

Utilisation du pooling pour les tests RT-qPCR

Présentateur(s) : Vincent Brault (maître de conférences en statistique à Grenoble)

L'une des problématiques de la pandémie actuelle de COVID-19 est la nécessité de pouvoir tester le plus largement possible les populations afin de mieux détecter la propagation et l'évolution. Toutefois, des problèmes techniques ont été mis en avant comme la tension sur la disponibilité des réactifs. Pour limiter ce problème, les méthodes de pooling (mélange de plusieurs échantillons avant de faire le test) sont régulièrement considérées en RT-qPCR (voir par exemple Gollier et Gossner (2020)).
Dans cet exposé, nous commencerons par expliquer en quoi consiste un test RT-qPCR et ce que cela implique sur les faux positifs et négatifs. Nous verrons ensuite le principe du pooling et comment cette procédure influence les résultats sur le taux de faux négatifs ; nous verrons en particulier l'importance de connaître la distribution de la concentration en charge virale. Nous continuerons donc sur la difficulté d'estimer cette concentration et nous conclurons par quelques procédures qui pourraient être appliquées pour aider en cette période de crise.

Lieu : Tours + zoom

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